Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms