Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc3P49135 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms