Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CitP49025 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CitP49025 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CitP49025 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CitP49025 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CitP49025 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CitP49025 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CitP49025 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CitP49025 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CitP49025 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms