Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms