Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms