Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NodalP43021 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NodalP43021 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NodalP43021 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NodalP43021 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NodalP43021 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NodalP43021 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NodalP43021 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NodalP43021 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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