Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tnfsf9P41274 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tnfsf9P41274 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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