Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbP41155 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbP41155 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LtbP41155 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LtbP41155 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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