Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfamP40630 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfamP40630 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TfamP40630 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TfamP40630 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TfamP40630 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TfamP40630 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TfamP40630 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TfamP40630 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms