Protein–RNA interactions for Protein: P38647

Hspa9, Stress-70 protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa9P38647 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspa9P38647 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms