Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms