Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin1P35438 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin1P35438 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms