Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cd28P31041 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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