Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprmP28828 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprmP28828 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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