Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms