Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms