Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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