Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms