Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms