Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms