Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsta3P23591 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms