Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms