Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms