Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Fcer1aP20489 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Fcer1aP20489 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Fcer1aP20489 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Fcer1aP20489 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Fcer1aP20489 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Fcer1aP20489 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms