Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms