Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SagP20443 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SagP20443 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms