Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Tnp1P10856 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms