Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sbk3P0C5K0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms