Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf1P09925 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf1P09925 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf1P09925 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf1P09925 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms