Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp2O88623 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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