Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlkO54988 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlkO54988 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlkO54988 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms