Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms