Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp1baO35930 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp1baO35930 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms