Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CaluO35887 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CaluO35887 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CaluO35887 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CaluO35887 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CaluO35887 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaluO35887 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaluO35887 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaluO35887 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms