Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaxO35602 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaxO35602 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaxO35602 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RaxO35602 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms