Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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