Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Clk4O35493 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clk4O35493 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clk4O35493 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk4O35493 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms