Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccrl2O35457 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ccrl2O35457 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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