Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Atf6bO35451 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atf6bO35451 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atf6bO35451 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atf6bO35451 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atf6bO35451 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atf6bO35451 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atf6bO35451 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atf6bO35451 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atf6bO35451 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atf6bO35451 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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