Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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Abcc1O35379 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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Abcc1O35379 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc1O35379 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
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Abcc1O35379 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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