Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms