Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms