Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MttpO08601 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MttpO08601 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms