Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms