Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms