Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms