Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lipo1J3QME6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms