Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21863J3KMP8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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