Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pot1bH7BX60 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms