Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r6H3BK29 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms